图书档案馆下设有一办三部一科：办公室，流通部，阅览部，自动化部，档案科。

办公室：协助馆长处理日常行政业务，负责全馆的业务统计，管理业务档案及负责对外协调工作。

流通部：负责图书的组织、管理和借阅工作。

阅览部：负责报刊的组织、管理和阅览工作。

自动化部：负责图书馆自动化系统的运作和维护，多媒体阅览室管理和维护，开展情报咨询工作，图书档案馆网站建设和特色电子资源开发。

档案科：负责学院档案资料的收集、保管和利用。